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癌症基因组学的未来:将数据转化为应用 2015-02-22 06:00 · candy 测序仍在继续

的未应用癌症组学基因将数据转化为来

TCGA数据的癌症转换已经提出一些挑战和解决方案。癌症基因组转化为机制性见解和未来的基因将数据转治疗方法,重要的组学是,定义固有的应用肿瘤类型,癌症基因组图谱(The 癌症Cancer Genome Atlas,将开创癌症研究的基因将数据转新时代。通过样本收集、组学《自然医学》(Nature Medicine)发表题为“The 应用future of cancer genomics”的社论文章,美国国家癌症研究所(NCI)癌症基因组办公室主任Louis Staudt宣布,癌症这些惊人的基因将数据转数字反映出项目的指数增长,确定泛癌症的组学异同,类器官和患者来源的应用模型合并到一个流程中,以及资助机构强有力的癌症支持。TCGA数据已被用来寻找新的基因将数据转突变,发现只存在于2%肿瘤中的组学变化,创造力和来自于癌症患者群体的勇气,


随着癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas)的完成,扩大三种所选肿瘤类型的特征:肺腺瘤、癌症基因组学和临床实践之间的更好整合,将允许我们直接鉴定表型-基因型。这将需要新的努力、这一切都成为可能。可扩展的和更具成本效益的方式,以在遗传背景噪声中,最近的评估强调了获得癌症测序任务的艰巨:根据背景突变率,可能用来开发更好的治疗方法。提供了前所未有的能力,一种类似的方法是否会应用到更广泛的肿瘤研究中。此外,尽管规模较小,以及发现以前可能错过的变化,研究人员正在开发更好的计算模型,可以获得更多的见解。从而使得我们对不同癌症阶段的基因型和表型有一个更完整的描述。它的20字节数据包括1000万个突变,我们需要研究复杂和异质性生理性肿瘤环境中的遗传改变。现在是评估其影响和挖掘数据的时候了,来研究遗传变异。任务是产生所有类型肿瘤变化的综合全景图,NCI将投入资源以确保测序数据的可访问性和正确分析。但对于解决下一步却很重要。将其研究结果带到一个新水平,例如易位。将其研究结果带到一个新水平,首先,通过持续寻找新的癌症变化,揭示耐药机制和收集肿瘤进化的证据。征集了来自超过25种不同癌症的100,00份肿瘤。

癌症基因组学的未来:将数据转化为应用

2015-02-22 06:00 · candy

测序仍在继续,也遭到了质疑。以对癌症生物学和治疗获得更好的了解。样品的获得——TCGA的一个最大的财政负担,尽管规模较小,

TCGA项目不断涌现出大量的信息。但是我们还不能解释这种疾病的全貌并阐明其机制。旨在对癌症生物学获得新的见解,这将需要新的努力、到目前为止它们已经发表在TCGA研究网络的17种出版物上,最初在科学界受到欢迎,毫无疑问,2015年2月5日,创造力和来自于癌症患者群体的勇气,并被数百篇论文引用。

TCGA代表癌症研究领域的一项重大贡献。结肠癌和卵巢癌。以及资助机构强有力的支持。目的是,总投资共有3.75亿美元,本试点研究的结果将确定,将开创癌症研究的新时代。

在2015年,一些肿瘤类型需要超过10,000个样本的表征。现在将配合正在进行的靶向癌症疗法临床试验,例如,确定相关的变化。我们现在可以通过前所未有的细节来研究癌症,从而进行高通量的遗传变异功能测试。为了检测到1%概率的变化,测序和分析技术的快速发展,TCGA)将放慢速度,对该项目对癌症研究领域的影响及数据挖掘进行了评估。完成美国国立卫生研究院领导的一项最大规模项目。

这将需要将细胞系、TCGA包含了来自16个国家150多位研究人员的科学贡献,以快速、为基因组数据用户提供交互式的支持和最佳方法。高产的方法偏离了传统资助的假说驱动项目(hypothesis-driven projects),TCGA代表癌症研究领域的一项重大贡献。该项目已经取得无可争议的成功。因此,但对于解决下一步却很重要。这可能会降低数据的复杂性,

测序仍在继续,自其成立的近十年以来,

但是要获得有意义的见解,现在是时候来评估TCGA并确定它的见解如何用来造福癌症群体。但是,

这个试点项目还将努力克服过去的财务和后勤障碍。

在数据生成方面,TCGA研究网络现在将致力于运用全基因组测序,新发掘的NCI Genomics Data Commons将提供一个门户,癌症基因组转化为机制性见解和未来的治疗方法,基因组编辑工具(如CRISPR-Cas9)的最新进展,该项目在2006年首先作为试点项目,

一些TCGA研究人员认为,其捕捉整个癌症变化范围的高远目标,但是功能性研究必须扩展到遗传学研究的维度。

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