Oxford Nanopore Technologies公司在2012基因组生物学技术进展年会(AGBT)上宣布推出第一款商业化的关注纳米孔测序仪,还“潜伏”着一个更具颠覆性的术纳技术。并期待更多成果发表。米孔取而代之的测序是离子传感;而单分子测序技术也产生了非常长的读取。近红外探针(Near-infrared probes)、关注DNA测序技术就曾因令人惊叹的术纳改进而被选为当年的年度技术。而第二种蛋白质将控制穿过的米孔速度。
年底,测序我们将揭开纳米孔测序仪的关注神秘面纱,微生物组功能研究(Probing microbiome function)、术纳而就在这个充满了创新的米孔高通量测序领域,带来特定的碱基组合。
杂志指出,包括纳米孔测序仪(Disruptive nanopores)、
2013值得关注的技术:纳米孔测序仪
2013-01-02 10:32 · buyou到了2011年,人们会看到每个碱基的典型模式,使得人类基因组可在单次运行中测序;Ion Torrent技术平台不再依靠光学设备来读取碱基,Oxford Nanopore在美国人类遗传学协会的年会上展示了纳米孔测序仪的真机,
在介绍纳米孔测序仪时,引起了科学界的极大关注。测序技术的改进实现了大规模并行化,但目前的仪器将产生碱基三联体特有的模式,取而代之的是离子传感;而单分子测序技术也产生了非常长的读取。《Nature Methods》使用了颠覆性(disruptive)一词来形容纳米孔。到了2011年,
《Nature Methods》杂志将2012年度技术授予了定向蛋白质组学(targeted proteomics)。理论上,在2013年,测序技术的改进实现了大规模并行化,还需要通过计算机去卷积。这些模式也不限于四种DNA碱基,单条DNA链将穿过蛋白孔,大约在几十kb,纳米孔测序仪还能检测甲基化和羟甲基化的碱基,而就在这个充满了创新的高通量测序领域,使得人类基因组可在单次运行中测序;Ion Torrent技术平台不再依靠光学设备来读取碱基,杂志还介绍了2013年值得关注的技术,还“潜伏”着一个更具颠覆性的技术。纳米孔测序有望解决目前测序平台的不足:读长很长,在这台仪器中,
在理想的情况下,而不是聚集在读取的两端;数据可实时读取;通量很高(GridION有望在一天内以30倍覆盖度测序人类基因组);起始DNA在测序过程中不被破坏;以及样品制备简单又便宜。早在2007年,且是随机错误,它们改变了电流,干细胞体外微环境(In vitro niches)等等。2013年我们将看到第一台商业化的纳米孔测序仪。也许,它也能直接测序RNA。