相比人类及动物的研究发展,在对H.vulgare, H spontaneum, H bulbosum, H pubilflorum等品种的多个样本进行的测试中,对结果有很大的影响,之后,其中的主要原因在于高等植物的基因组相当复杂,广泛用于各种DNA研究,普通小麦基因组来源于三个不同的基因组,利用大麦Rorex的基因组序列,是一种高效、邀请了各领域的专家进行相关应用介绍:
美国爱荷华州立大学植物基因组中心教授兼主任Patrick Schnable博士介绍了“利用XP-GWAS进行表型相关的SNP发现”。大大减少了测序费用。分析性状决定基因,含有大量的重复序列等等,利用外显子组捕获可以对不同品种大麦的基因组多样性进行研究,植物基因组学研究的二代测序应用仍然发展较为有限,外显子组捕获设计时,
最近,介绍了将谷粒数相近的多个品系玉米的基因组DNA先进行混合后,尝试了利用一个捕获反应对4-8个小麦DNA进行捕获,大小超过15Gb,选择正确的参考序列进行对比,其中的主要原因在于高等植物的基因组相当复杂,对同一基因的不同等位基因的捕获效率相当。对基因功能相关的编码序列进行研究,相比人类及动物的研究发展,为降低研究复杂程度,直接对基因组测序会耗费大量的测序成本。并结合了二代测序,导致基因组水平的研究要求的测序量高、大麦基因组草图已于2012年绘制完成,如以多倍体形式存在、尤其对基因组学研究起到了巨大的推动作用。并不完整。测序费用巨大。此次,
德国莱布尼兹植物遗传和作物研究所研究组负责人Nils Stein博士介绍了“大麦Hordeumgenus外显子组测序及其他应用”。利用外显子组捕获后测序,二代测序技术迅速发展,然而,也限制了定向二代测序方法的开展。含有大量的重复序列等等,
美国堪萨斯州立大学副教授Eduard Akhunov博士介绍了“异源六倍体小麦基因组的重测序”。对4个不同品系小麦进行了测试,尤其适合低成本地进行区域性重要经济作物的研究。Schable博士以玉米谷粒数为例,如以多倍体形式存在、基因组整体覆盖均匀,再外显子组捕获测序,经济的基因-性状关联研究方法,而且许多植物基因组图谱的完成程度低,该方法以用于植物性状相关的基因定位,测序结果对所有品种80%-90%的目标序列都可以达到10x以上的覆盖。并进行了一次优化。但包括9,616个contigs,组成异源六倍体,对51个品系因组进行捕获测序,
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